So súostrovím Santorini je často spájaný pojem “kaldera¨. Ide o útvar sopečného pôvodu, ktorý vznikol tým, že po silnej erupcii sa stred sopky prepadol a kráter následne zalialo more. Takto vzniklo i Santorini, ktoré je vlastne pozostatkom obrovskej sopky. Kedysi všetky ostrovy súostrovia Santorini - Théra, Therasia, Aspronisi a Kameni a ďalšie menšie ostrovčeky tvorili jeden veľký sopečný ostrov. Výbuch, ktorý ostrov rozdelil, je dodnes považovaný za jeden z najväčších výbuchov sopky v histórii Zeme. Erupcia bola taká silná, že dokonca zničila minojskú civilizáciu na 110 km vzdialenej Kréte.
Najsevernejšou časťou kaldery je mesto Oia. Je obľúbenou zastávkou turistov a narazíte tu na pulzujúci život. Množstvo barov, reštaurácií, hotelov, ktoré sú zasadené v skalnatých výbežkoch, z ktorých možno sledovať nádhernú panorámu.
Hlavné mesto Fira je situovaná vo východnej časti kaldery. Rozkladá sa na niekoľkých vysokých útesoch, ktoré sa týčia do výšky až 1200 metrov nad morom. Fira, rovnako ako mesto Oia, ponúka turistom množstvo hotelov a reštaurácii a tiež miest, odkiaľ si možno vychutnávať dychberúce výhľady na kalderu.
Kaldera na Santorini je považovaná za jeden z najdôležitejších úkazov na planéte Zem a je neustále predmetom výskumu v oblasti geológie a archeológie.